المدرسة القرآنية الداخلية التابعة لمسجد علي بن أبي طالب برقان ،تعنى بتعليم القرآن الكريم واللغة العربية وعلوم الفقه والحديث والعقيدة الإسلامية . تأسست سنة 1988 ضمن الإطار المعمول به في نظام الشؤون الدينية والأوقاف ،قام بتأسيسها الشيخ الدباغي عبد الكريم بعد أخذ ترخيص من الوزارة المعنية برتبة إمام مدرس آنذاك ،وهي تقوم بإعداد الأئمة والدعاة والفقهاء ليلتحقوا بها بعد إجراء مسابقة أولية بمعاهد حكومية تابعة لوزارة الشؤون الدينية والأوقاف ،يتخرج منها إطارات ،أئمة مدرسون ،أئمة معلمون ،أساتذة للتعليم القرآني، أعوان، مؤذنون، ويلتحق بعضهم بالجامعات بعد حصولهم على شهادة البكالوريا من المدارس الرسمية .يشرف على المدرسة مؤسسها الشيخ الدباغي عبد الكريم عضو المجلس الإسلامي الأعلى ،مهمته الإشراف العام ومباشرة التدريس واستقبال الطلبة الجدد والإشراف على تخرج الطلبة ،فيما تتم عملية التأطير من طرف إمام مدرس،إمام مقرئ، أستاذ التعليم القرآني،إمام مساعد قائم بالإمامة ،هؤلاء يقومون بالتعليم القرآني للطور الأول والثاني ويستمر حوالي 6 سنوات .أما هيئة التدريس فتضم إمام مفتش،و03 أساتذة من خريجي الجامعات . حيث يقوم هؤلاء بإلقاء الدروس والمحاضرات ،والإشراف على الحلقات العلمية لطلبة الصف الثالث والرابع والخامس ويستمر حوالي 4 سنوات .كما تتوفر المدرسة على داخلية يشرف عليها 12 عاملا موزعين على الإيواء والمراقد والصيانة والطبخ .وبخصوص المواد التي تدرس بهذه المؤسسة الدينية فهي ،القرآن الكريم،علوم القرآن،الحديث،علوم الحديث،الفقه ،أصول الفقه ،اللغة العربية وعلومها ،السيرة النبوية ،التاريخ الإسلامي ،علوم التربية والسلوك . أما المنهج التنظيمي للمدرسة فينقسم إلى 5 أطوار ،الصف الأول والثاني للقرآن وعلوم القرآن والتجويد ومدته 6 سنوات ، الصف الثالث لإتقان القرآن ومعرفة أولية بالتفسير وعلوم القرآن ،والصف الرابع والخامس ،لعلوم الفقه واللغة العربية والتربية والسلوك .